从3月5日清晨起，因南门汽车站动迁工程启动，一分公司11条岛内线路和5条省际线路全部按新的始发点营运。分公司干部和现场管理人员一清早就在南门路和亚通码头广场上岗，郭奇章、任井春等公司领导巡视了各处集散点，各线营运秩序正常。
截止3月4日，一分公司所有场所、设施基本搬迁结束，新搭建的调度室进入工作状态。按照新的站点设置方案，在南门路南侧为南长线、南隆线和二分公司南堡线、南堡支线的始发站，北侧则分别是新落成的南江线、南风线、南跃线和南牛线4个候车廊；南门码头广场已成为5条岛内线路和5支出省线路的临时客运枢纽中心，南海、南红、南建、南东和旅游5号线，以及开往江苏、山东等地的班车在这里始发。由于面积有限，线路集中，加上轮船班次多、客流分散，分公司加强了现场管理的力量，以确保营运作业的正常有序。
据现场的观察和了解，乘客对各分散的站点一时还不能适应和了解，但一些乘客对南门路北侧的走廊式候车站感到新鲜，认为有一种在市区候车的氛围，无形中也为南门花园广场的周边地区增添了一道风景。另各处分散的新站点给司售人员带来诸多的不便，特别是售票员到站后的签票必须走一段路程，但大家表示将克服暂时困难。
目前新的南门汽车站选址、设计正在积极筹划中。
